Institut Municipal d'Investigació Mèdica - Hospital del Mar



Portada > Programes de recerca > Informàtica biomèdica >

Informàtica biomèdica integrada Ferran Sanz

Aquest grup de recerca constitueix una plataforma específica per a l'activitat de recerca directa, portada a terme pel director del GRIB, Ferran Sanz, així com per a la promoció d'iniciatives a gran escala, l'objectiu de la qual consisteix en aprofitar les aportacions sinèrgiques de diversos laboratoris del GRIB. Aquest grup està format per un científic doctorat i dos estudiants de doctorat.

Un clar exemple d'aquestes iniciatives a gran escala és la Xarxa d'Excel·lència INFOBIOMED ,finançada per la UE. Aquesta xarxa d'excel·lència ha estat activa durant el període 2004-2007 amb l'objectiu general d'estructurar la Informàtica Biomèdica Europea per a donar suport a l'assistència sanitària personalitzada. Dirigida per Ferran Sanz, participa activament en els grups de recerca del GRIB dirigits per M. Albà, B. Oliva i J. Mestres. Un cas semblant és la participació del GRIB en el projecte integrat@neurIST finançat per la UE, una iniciativa europea per a integrar la informàtica biomèdica en la gestió de aneurismes cerebrals. En aquest cas els directors d'equips del GRIB amb participació activa són B. Oliva, J. Villà, M. Pastor i F. Sanz.

El CancerGRID és altre exemple de projecte finançat per la UE en el qual participen científics de diferents laboratoris del GRIB (J. Mestres, I. Zamora i F. Sanz). L'objectiu d'aquest projecte consisteix a desenvolupar i millorar els mètodes per a augmentar els arxius moleculars i així facilitar el descobriment de possibles agents anticancerígens. S'està seguint la mateixa estratègia en les propostes enviades a les primeres convocatòries del VII Programa Marc Europeu. Un clar exemple el tenim en el projecte ALERT per a la detecció primerenca d'efectes farmacològics adversos mitjançant la recerca integrada en històries clíniques i altre coneixement biomèdic. Aquest projecte ha estat seleccionat per a rebre el finançament en la primera convocatòria i s'iniciarà a principis de 2008. La contribució del GRIB en el projecte ALERT es portarà a terme principalment pels grups dirigits per J. Mestres i F. Sanz i se centrarà en la generació automàtica d'explicacions sòlides, científiques i mecàniques per als senyals obtinguts en la recerca d'històries clíniques a través d'una combinació d'anàlisi de literatura i bases de dades biomèdiques, prediccions in silic i mapeix de vies.

A nivell espanyol, la mateixa filosofia integradora va fer que el GRIS participés en la xarxa temàtica INBIOMED, finançada pel ISCII, que va funcionar de 2003 a 2006. Per a la convocatòria de 2007 del ISCIII es va enviar una nova proposta de xarxa temàtica (COMBIOMED). La participació del GRIB en l'Institut Nacional de Bioinformàtica és un altre exemple de la participació conjunta de diversos laboratoris del GRIB en iniciatives estratègiques.

D'altra banda, F. Sanz està especialment interessat en l'aplicació de la informàtica biomèdica en l'àmbit farmacèutic. En aquest camp, actualment està interessat en la gestió i l'explotació del coneixement integrador. La seva participació en les plataformes tecnològiques europea www.imi-europe.org i espanyola www.medicaments-innovadors.org sobre medicaments innovadors representen activitats bàsiques en aquest àmbit. En concret, està actuant com expert convidat per la Comissió Europea i la EFPIA, coordinant la plataforma espanyola.

Una altra iniciativa conjunta en el camp farmacèutic que s'està fomentant és el ChemBioBank, una iniciativa conjunta del Parc Científic de Barcelona i la Unitat de Serveis d'Avaluació Farmacológica de la Universitat de Santiago de Compostel·la i el GRIB (Jordi Mestres i Ferran Sanz). Té per objectiu recopilar apunts in vitro i in silit, així com difondre i explotar la diversitat química espanyola generada públicament.

A selection of recent scientific publications of F. Sanz is: 

  • Gutiérrez-de-Terán H, Centeno NB, Pastor M, Sanz F. Novel approaches for modeling of the A1 adenosine receptor and its agonist binding site. Proteins 2004; 54:705-15. 
  • Fontaine F, Pastor M, Sanz F. Incorporating Molecular Shape into the Alignment-free GRid-INdependent Descriptors (GRIND). J Med Chem 2004; 47: 2805-15. 
  • Fontaine F, Pastor M, Zamora I, Sanz F. Anchor-GRIND: Filling the gap between standard 3D-QSAR and the GRid-INdependent Descriptors. J Med Chem 2005; 48: 2687-94. 
  • Bonis J, Furlong LI, Sanz F. OSIRIS: a tool for retrieving literature about sequence variants. Bioinformatics 2006; 22: 2567-9. 
  • Dezi C, Brea J, Alvarado M, Raviña E, Masaguer CF, Loza MI, Sanz F, Pastor M. Multi-structure 3D-QSAR studies on a series of conformationally constrained butyrophenones docked into a new homology model of the 5-HT2A receptor. J Med Chem 2007; 50: 3242-55. 
  • Klinger R, Furlong LI, Friedrich CM, Mevissen HT, Fluck J, Sanz F, Hofmann-Apitius M. Identifying Gene Specific Variations in Biomedical Text. J Bioinform Comput Biol (in press).

© IMIM Institut Municipal d'Investigació Mèdica 2008 - Avís legal - Accessibilitat