Grupo: ---- Bioinformática estructural, Baldomero Oliva Bioquímica y biofísica computacionales, Jordi Villà-Freixa Genómica computacional, Mar Albà Diseño de fármacos asistido por ordenador, Manuel Pastor Informática biomédica integrada, Ferran Sanz Quimiogenómica, Jordi Mestres

El CancerGRID es otro ejemplo de proyecto financiado por la UE en el que participan científicos de diferentes laboratorios del GRIB (J. Mestres, I. Zamora y F. Sanz). El objetivo de este proyecto consiste en desarrollar y mejorar los métodos para aumentar los archivos moleculares y así facilitar el descubrimiento de posibles agentes anticancerígenos. Se está siguiendo la misma estrategia en las propuestas enviadas a las primeras convocatorias del VII Programa Marco Europeo. Un claro ejemplo lo tenemos en el proyecto ALERT para la detección temprana de efectos farmacológicos adversos mediante la búsqueda integrada en historias clínicas y otro conocimiento biomédico. Este proyecto ha sido seleccionado para recibir la financiación en la primera convocatoria y se iniciará a principios de 2008. La contribución del GRIB en el proyecto ALERT se llevará a cabo principalmente por los grupos dirigidos por J. Mestres y F. Sanz y se centrará en la generación automática de explicaciones sólidas, científicas y mecánicas para las señales obtenidas en la búsqueda de historias clínicas a través de una combinación de análisis de literatura y bases de datos biomédicas, predicciones in silico y mapeo de vías.

A nivel español, la misma filosofía integradora hizo que el GRIS participara en la red temáticaINBIOMED, financiada por el ISCII (www.inbiomed.retics.net), que funcionó de 2003 a 2006. Para la convocatoria de 2007 del ISCIII se envió una nueva propuesta de red temática (COMBIOMED). La participación del GRIB en el Instituto Nacional de Bioinformática es otro ejemplo de la participación conjunta de diversos laboratorios del GRIB en iniciativas estratégicas.

Por otro lado, F. Sanz está especialmente interesado en la aplicación de la informática biomédica en el ámbito farmacéutico. En este campo, actualmente está interesado en la gestión y la explotación del conocimiento integrador. Su participación en las plataformas tecnológicas europea www.imi-europe.org y española www.medicamentos-innovadores.org sobre medicamentos innovadores representan actividades básicas en este ámbito. En concreto, está actuando como experto invitado por la Comisión Europea y la EFPIA, coordinando la plataforma española.

Otra iniciativa conjunta en el campo farmacéutico que se está fomentando es el ChemBioBank, una iniciativa conjunta del Parque Científico de Barcelona y la Unidad de Servicios de Evaluación Farmacológica de la Universidad de Santiago de Compostela y el GRIB (Jordi Mestres y Ferran Sanz). Tiene por objetivo recopilar apuntes in vitro e in silito, así como difundir y explotar la diversidad química española generada públicamente.

 Entre las últimas publicaciones científicas de F. Sanz encontramos:

• Gutiérrez-de-Terán H., Centeno N.B., Pastor M., Sanz F. Novel approaches for modeling of the A1 adenosine receptor and its agonist binding site. Proteins 2004; 54:705-15.
• Fontaine F., Pastor M., Sanz F. Incorporating Molecular Shape into the Alignment-free GRid-INdependent Descriptors (GRIND). J Med Chem 2004; 47: 2805-15.
• Fontaine F., Pastor M., Zamora I., Sanz F. Anchor-GRIND: Filling the gap between standard 3D-QSAR and the GRid-Independent Descriptors. J Med Chem 2005; 48: 2687-94.
• Bonis J, Furlong LI, Sanz F. OSIRIS: a tool for retrieving literature about sequence variants. Bioinformatics 2006; 22: 2567-9.
• Dezi C., Brea J., Alvarado M., Raviña E., Masaguer C.F., Loza M.I., Sanz F., Pastor M. Multi-structure 3D-QSAR studies on a series of conformationally constrained butyrophenones docked into a new homology model of the 5-HT2A receptor. J Med Chem 2007; 50: 3242-55.
• Klinger R., Furlong LI., Friedrich C.M., Mevissen H.T., Fluck J., Sanz F., Hofmann-Apitius M. Identifying Gene Specific Variations in Biomedical Text. J Bioinform Comput Biol (en prensa).