IMIM - Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques

Farmacologia de sistemes Jordi Mestres

El Grup de farmacologia de sistemes va ser creat el setembre de 2003 i forma part del Programa de Recerca en Informàtica Biomèdica, un dels programes de recerca de l'Institut de Recerca de l'Hospital del Mar (IMIM). Investiguem en la interfície entre la química i la biologia, on el focus actual és el desenvolupament d'eines i bases de dades de bioquimioinformática, l'anàlisi topogràfica de superfícies moleculars i el disseny de protocols per al cribratge virtual.

El nostre objectiu és desenvolupar i aplicar eines informàtiques per a la identificació sistemàtica de molècules actives perquè s'utilitzin famílies terapèuticament rellevants ja sigui, al principi, com sondes químiques de validació o bé, al final, com blancs per a la generació principal dins dels processos de descobriment farmacològic.

Projectes 

  • EU-ADR ALERT: detecció primerenca de reaccions farmacològiques adverses mitjançant l'extracció integrativa de registres clínics i coneixement biomèdic. L'objectiu general d'aquest projecte és el disseny, desenvolupament i validació d'un sistema informatitzat que exploti les dades dels registres sanitaris electrònics i les bases de dades biomèdiques per a la detecció primerenca de reaccions farmacològiques adverses. El sistema ALERT generarà senyals mitjançant l'extracció de dades i text, tècniques epidemiològiques i altres tècniques informàtiques i, en conseqüència, ha de confirmar aquestes senyals per aclarir al coneixement actual dels mecanismes biològics i les capacitats de predicció in silico. El sistema hauria de ser capaç de detectar senyals d'una manera millor i més ràpida que els sistemes de registre espontanis i hauria de permetre identificar subpoblacions amb un risc més elevat de RFA. Llegir més 
  • CancerGrid: sistema informàtic en xarxa per al disseny de fàrmacs d'efecte ràpid contra el càncer. El consorci desenvoluparà i perfeccionarà mètodes per a l'enriquiment de les biblioteques moleculars per facilitar el descobriment de possibles agents contra el càncer. Utilitzant tecnologia informàtica en xarxa, juntament amb els nous mètodes d'enriquiment de biblioteques, la probabilitat de descobrir noves pistes contra el càncer es veurà incrementada substancialment, però, la tecnologia resultant serà inservible per a altres objectius biològics. Llegir més 
  • Desenvolupament de noves metodologies basades en el coneixement per al refinament de models de proteïnes diana i la seva aplicació al disseny dirigit de compostos: el modelatge d'estructures proteiques per homologia sovint és l'única font d'informació estructural per dissenyar molècules dirigides a proteïnes diana o famílies diana farmacològicament rellevants. Encara que els mètodes per modelar estructures proteiques han millorat considerablement en els últims anys, la qualitat dels models estructurals derivats poques vegades resulta suficient per a la seva aplicació en el disseny de molècules basat en estructures. No obstant això, en paral·lel als avenços en determinació i modelatge d'estructures proteiques, s'han sintetitzat i caracteritzat un gran nombre de molècules amb els anys i, recentment, en els assajos bioquímics, s'ha provat la seva afinitat d'unió a les proteïnes. El principal objectiu del projecte és incorporar de forma sistemàtica totes les dades acumulades al centre de química en protocols de modelatge per homologia per produir models proteics de millor qualitat que siguin consistents amb les característiques estructurals dels lligands coneguts. Llegir més 
  • Desenvolupament de plataformes tecnològiques comunes dirigides a la identificació de candidats a desenvolupament preclínic en diverses àrees terapèutiques. Aquest projecte té dos objectius principals: d'una banda, construir una biblioteca química amb comentaris a dianes directament associades amb malalties concretes (dolor i obesitat) i, d'altra banda, dissenyar, implementar i aplicar noves estratègies quimiogenómicas basades en el coneixement per a la identificació sistemàtica de nous blancs per determinades dianes d'especial rellevància terapèutica. Llegir més 
  • Desenvolupament d'una plataforma Quimiogenòmica per a la identificació de fàrmacs en famílies de proteïnes: aquest projecte consisteix a desenvolupar una plataforma Quimiogenòmica que, en explotar al màxim la informació a les dianes i lligands disponibles fora d'allà, produeixi normes basades en coneixement per al cribratge in silico de biblioteques virtuals. Això possiblement permeti la identificació d'estructures privilegiades personalitzades per famílies diana senceres de considerable interès terapèutic, per tant, ofereix oportunitats no només per dirigir programes de descobriment, sinó també per a un tipus químic de validació de dianes de manera Quimiogenòmica.Llegir més 
  • INFOBIOMED: estructuració d'informàtica biomèdica europea per ajudar a l'assistència sanitària individualitzada. L'objectiu de la xarxa INFOBIOMED és establir una estructura durable per l'enfocament col · laboratiu descrit a nivell europeu, mobilitzant la massa crítica de recursos necessaris per permetre l'enfocament col·laboratiu que dóna suport a la consolidació de la informàtica biomèdica com una disciplina científica crucial per a l'assistència sanitària futura . L'objectiu de les aplicacions pilot en àmbits concrets rau en demostrar els beneficis d'un enfocament sinergístic a la informàtica biomèdica.Llegir més
  • Perfilat farmacològic in silico de molècules per famílies de proteïnes d'especial rellevància per a la salut humana: la Quimiogenòmica ha sorgit recentment com una disciplina situada entre la química i la biologia que intenta explotar les similituds fonamentals retingudes entre els membres d'una determinada proteïna o entre proteïnes successives d'una ruta donada per al disseny de biblioteques moleculars dirigides a les famílies i / o dirigides a les rutes. L'aplicació de les estratègies quimiogenómicas a la investigació cardiovascular busca plantejar el descobriment farmacològic de malalties cardiovasculars d'una manera més sistemàtica i basada en el coneixement, establint un continu d'informació del lligand a la diana ia la ruta en aquesta àrea terapèutica, amb el potencial d'identificar estructures privilegiades presents en les molècules centrades en membres proteics de famílies diana i rutes associades a malalties cardiològiques.Llegir més

Contacte

Coordinador:
Jordi Mestres

Tel:
93 316 05 26

Fax:
93 316 05 50

Doctor Aiguader, 88
08003 Barcelona

© Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques Nota legal | Política de cookies | Mapa web | Accessibilitat | Adreça / Accessos | Contacte