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Genòmica evolutiva (Mar Alba)

Mar Albà se unió a la UPF con la beca Ramón y Cajal en 2002 y en octubre de 2005 se la nombró Catedrática de Investigación del ICREA en la FIMIM. También cuenta con el cargo de catedrática adjunta en la UPF. Cuenta con un Doctorado en Ciencias Biológicas y trabajó en la University Collage London y en el Medical Research Council (Reino Unido) entre 1997 y 2001. Ha publicado 33 artículos en revistas con comité de expertos y ha colaborado en 5 capítulos de libros. Mar Albà coordina el Grupo de Genómica Evolutiva en el que participan diversos alumnos de doctorado.

Utilizamos la genómica comparativa para aprender sobre la evolución y la función del genoma.

Tenemos tres líneas principales de investigación:

1. Innovación evolutiva en las secuencias de codificación génica. El repertorio de genes humanos es un mosaico formado por genes de origen muy antiguo, presentes en todos los seres eucarióticos y por otros genes con un origen más reciente. Hemos establecido la fecha de aparición de los genes en el genoma humano mediante la filogenia de los seres eucarióticos y hemos demostrado que los genes más recientes presentan una aceleración en el ritmo evolutivo. Hemos realizado diversos estudios para comprender los mecanismos de formación de nuevos genes. También estamos interesados en la comprensión de la contribución del motivo corto de DNA y las repeticiones en tándem de aminoácidos únicos a las innovaciones específicas del taxón.

2. Redes de transcripción génica. Las regiones de genes contienen una gran cantidad de motivos que participan en la regulación de la transcripción. Hemos desarrollado diferentes métodos para predecir los motivos reguladores (PROMO, PEAKS), partiendo de información sobre las vías y la conservación de la disposición de los motivos en muchos genes humanos y murinos distintos. Hemos identificado un gran número de nuevos motivos reguladores que es probable que sean importantes para la regulación de la expresión génica específica del tejido.

3. Predicción de interacciones virus-huésped. Hemos utilizado búsquedas de secuencias basadas en perfiles para captar la homología génica distante entre el virus y los genomas humano y murino, y se han indicado los sucesos de transferencia génica horizontal entre huésped y patógeno. La identificación de residuos conservados en alineaciones múltiples ha llevado a la predicción de interacciones proteicas virus-huésped en el contexto de las vías de respuesta inmunitaria.