Anar al web de l'Imim

Imima’t - Divulguem la ciència - IMIM Institut Municipal d’Investigació Mèdica


Bloc

Arxiu de la categoria ‘Coneix l'IMIM’

Publicat per El.lipse

Divendres, 20 gener 2012

Coneix l'IMIM

Simulacions moleculars

En aquesta imatge d’Ignasi Buch, del grup de Biofísica Computacional del GRIB (IMIM/UPF), s’observa una simulació de la unió d’un fàrmac a la seva proteïna diana. La molècula hexagonal petita (benzamidina) representa el fàrmac, en aquest cas un inhibidor de la tripsina, la molècula grisa volumètrica de la imatge.

La tripsina és un enzim amb la funció de tallar proteïnes. Quan la benzamidina s’uneix a la tripsina evita que altres proteïnes s’uneixin i, per tant, que la tripsina les pugui tallar. Aquesta simulació
mostra com, per poder unirse i inhibir la tripsina, la benzamidina primer interacciona amb diverses regions que l’ajuden a trobar el seu lloc final d’unió.

Ser capaços d’entendre aquest camí que ha de fer la benzamidina dóna pistes addicionals
a l’hora de dissenyar fàrmacs més eficients.

Aquest article va ser publicat al diari El.lipse, la publicació que es realitza al PRBB amb la col.laboració de tots els centres que el conformen.

Publicat per Reimund Ficker

Dijous, 29 desembre 2011

Coneix l'IMIM

Patents biomèdiques

Una patent és un dret exclusiu concedit per un Estat a un inventor per un període fix de temps a canvi de la divulgació pública de la seva invenció. Això proporciona a l’inventor el dret d’excloure tercers d’utilitzar o vendre la invenció patentada durant 20 anys a partir de la data de presentació de la patent.

Les patents han de complir tres requisits: la invenció ha de ser nova, ha d’haver comportat una activitat inventiva i ha de descriure una aplicació tècnica.

Els descobriments no són patentables; la invenció ha de ser un producte o procés industrial creat per l’inventor. A partir de la presentació d’una patent, el contingut pot ser publicat en una revista científica, però mai abans. La patent esmanté en secret durant 18 mesos i després es fa totalment pública a través de bases de dades com Espacenet.

Les patents són cares. Els primers 30 mesos pot costar entre 10.000 i 15.000 euros, i les següents fases, de 25.000 a 30.000 euros, a més de les quotes anuals per mantenir la protecció. En el món acadèmic les patents són sobretot d’aplicacions. Una patent pot ser atorgada com a molt aviat en tres anys, però es pot trigar sis anys a obtenir l’aprovació final.

En recerca, les bases de dades de patents proporcionen informació útil. Però la raó principal per patentar una innovació biomèdica és permetre a una empresa privada el desenvolupament d’un medicament. Això pot costar fins a 800 milions d’euros i trigar de 12 a 15 anys. Per això les empreses volen assegurarse que podran vendre el medicament en exclusiva almenys durant cinc anys.

El temps dirà si el sistema de patents actual és adequat per resoldre els problemes de salut més urgents al món, però, ara com ara, si un científic inventa un nou medicament, patentar podria ser l’única solució perquè algun dia s’apliqui a la clínica.

Aquest article va ser publicat al diari El.lipse, la publicació que es realitza al PRBB amb la col.laboració de tots els centres que el conformen.

Publicat per Marta Lopez

Dijous, 1 desembre 2011

Coneix l'IMIM

Tendències en recerca biomèdica: LA INNOVACIÓ

En la recerca, com en altres àmbits de la societat, existeixen tendències. Es pot pensar, erròniament o no, que només són paraules que en un moment determinat es posen de moda, però segurament és molt més que això.

Qui no recorda quan la paraula clau era la translació? De fet , la paraula es farà servir més o menys ara, però la idea continua sent vàlida. La biomedicina ha de ser capaç de respondre preguntes que es deriven de la pràctica clínica combinant la investigació bàsica amb la més clínica. Ara però s’utilitza l’etiqueta “from bench to bed”.

També hem viscut la moda dels “omics”. No podia haver un projecte en biomedicina que no inclogués la utilització de plataformes de genòmica, proteòmica o metabolòmica. La tecnologia avança i els equipaments cada cop són més potents i sembla lògic que s’utilitzin massivament aquestes oportunitats. No obstant, caldria potser avaluar quina incidència real han tingut o tenen aquestes tècniques per donar resposta al reptes en aquest àmbit de la ciència.

Actualment, la Unió Europea està acabant de definir quin serà el programa de continuïtat del 7è Programa Marc. Per decidir quin nom havia de tenir, es va fer una enquesta d’àmbit europeu i es va escollir Horizon 2020. Pel que no van haver de fer enquesta va ser per decidir quina hauria de ser la paraula clau per aquest nou programa i la paraula és innovation. Sí, que tothom ho sàpiga, la paraula a utilitzar és innovació. A Europa ho tenen clar, no és sostenible finançar recerca que no pugui arribar de manera molt directe al sector productiu. Tornem a sentir que la recerca ha de ser el motor econòmic i si Europa té bons investigadors, això ha de poder tenir conseqüència directe en la millora de la competitivitat de les seves industries.

A nivell estatal, d’una manera més modesta, també hi ha cada vegada més iniciatives que busquen que centres de recerca i empreses presentin projectes comuns, que assegurin un nou producte per a l’empresa o una millora en un procés o el desenvolupament d’una tecnologia. Això està fent que cada vegada tinguin més rellevància els anomenats centres tecnològics, entitats sectorials que van ser creades per a donar respostes de recerca i desenvolupament a empreses que, per dimensions, autònomament no podien fer recerca. Un exemple de centres tecnològics seria leitat o ascamm, entre d’altres (podeu trobar més informació a www.actec.cat).

Per últim, també volia destacar una altra tendència: la innovació als hospitals. Cada vegada més s’estan apropant als hospitals diferents actors (centres tecnològics, empreses i inversors) interessats en poder recollir necessitats, problemes i possibles solucions en les activitats realitzades als hospitals. Molts hospitals ja compten amb el seu propi director d’innovació. No estem parlant només dels ja famosos medical Device, sinó també de millora de processos que optimitzin recursos. L’entorn hospitalari és l’ideal perquè persones amb inquietuds, independentment del seu perfil (innovar pot innovar des del cap de servei fins al zelador), davant d’un problema que detecten en el seu dia a dia, puguin imaginar possibles solucions. La bona notícia és que ara s’estan posant a l’abast més eines que permetin fer tangibles aquestes solucions, sempre que siguin econòmicament beneficioses.

Com a conclusió diria que les tendències en sí no són bones ni dolentes, són el que són, però és important conèixer-les per, a ser possible, aprofitar-les.

Marta López és la responsable del servei de Recerca de l’IMIM (Institut de Recerca Hospital del Mar)

  • Cap comentari »

Publicat per Heinz Himmelbauer

Dimarts, 22 novembre 2011

Coneix l'IMIM

Seqüenciació exhaustiva del genoma

La tradicional seqüenciació d’ADN, concebuda pel doble guanyador del premi Nobel Frederick Sanger en els anys setanta, ha estat tremendament reeixida des de fa 25 anys. Malgrat el seu cost, molts genomes, incloent-hi l’humà, s’han seqüenciat utilitzant el mètode de Sanger. Però el mètode té les seves limitacions; per exemple, només es poden seqüenciar 384 fragments d’ADN alhora.

En els darrers sis anys, han sorgit les anomenades tecnologies de deep sequencing, o seqüenciació exhaustiva, que, amb un cost baix, permeten seqüenciar un gran nombre de fragments d’ADN ―fins a 1.000 milions― a la vegada.

El genoma humà té uns 3.000.000.000 parells de bases o “lletres”. Com que les molècules d’ADN són molt llargues, el primer pas en seqüenciar-les és fer servir mètodes físics per fragmentar-les en trossos d’uns 500 parells de bases. Aquests fragments són processats després de forma diferent segons la plataforma que s’usarà per determinar-ne la seqüència. En el cas de la seqüenciació Solexa/Illumina, l’ADN s’introdueix en un portaobjectes de vidre de 3 x 7,5 cm en el qual poden ser seqüenciats alhora fins a un bilió de fragments d’ADN. Un cop obtinguda la seva seqüència, els fragments han de ser reorganitzats per reconstruir la molècula original.

La reconstrucció de la seqüència del genoma humà va trigar anys a fer-se usant tecnologies tradicionals i a un cost de més de tres mil milions de dòlars. Gràcies a aquestes noves tecnologies, ara es pot fer en menys d’un mes, a un cost d’uns 10.000 dòlars. En conseqüència, moltes preguntes científiques cada vegada més sovint són resoltes utilitzant aquest nou tipus de seqüenciació.

Al PRBB, la seqüenciació exhaustiva s’ha ofert com un servei des de l’any 2008. Està equipada amb quatre aparells de seqüenciació amb un cost d’entre mig milió i un milió d’euros cadascun.

Aquest article va ser publicat al diari El.lipse, la publicació que es realitza al PRBB amb la col.laboració de tots els centres que el conformen.

  • Cap comentari »

Publicat per Marta Calsina

Dilluns, 3 octubre 2011

Coneix l'IMIM

Extreu el teu propi ADN!

Amb un senzill experiment i algunes instruccions us convidem a extreure el vostre propi ADN . Aquest és un dels diferents experiments que es van poder realitzar durant la Jornada de Portes Obertes del Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (PRBB) i que us fem extensiu per si el voleu provar de fer amb els vostres companys.

Què necessites?

15 ml d’aigua salada (1 cullerada sopera de sal/ 500 ml d’aigua potable), 1 tub de plàstic o un got de vidre, sabó transparent, 15 ml d’etanol de 96%  i 1 escuradents.

Què has de fer:

1. Posar 15 ml d’aigua salada en el tub de plàstic.
2. Rasqueu l’interior de la boca amb un escuradents.
3. Poseu-vos tota l’aigua salada del tub dins la boca. Sense empassar-vos l’aigua feu gàrgares i remeneu l’aigua bé per tota la boca durant una estona. Escopiu l’aigua un altre cop al tub.
4. Submergiu un escuradents llarg en la gota de sabó de mans i remeneu-lo suaument en el tub. Per tal que es formi menys escuma en el tub, el millor és remenar només dues o tres vegades.
5. Utilitzeu el comptagotes per tirar l’etanol per la paret interior del tub. Intenta afegir l’etanol amb molta suavitat, perquè l’aigua i l’etanol no es barregin.
6. L’objectiu és que l’etanol formi una capa separada a la superfície de l’aigua. Mantenir el got en un angle de 20 graus mentre ho fas t’ajudarà.
7. Mira com filets d’ADN s’ajunten en l’etanol. Els fils s’uneixen i formen una mena de xarxes d’ADN. Mira-ho bé, és una part de tu que no veus mai!
8. Si el líquid està molt tèrbol, prova de fer l’experiment de nou afegint l’alcohol més lentament.

Què ha passat?
Les cèl·lules de la pell dins de la teva boca han estat fàcilment extretes al fer gàrgares. S’ha utilitzat aigua salada perquè imita els fluids salats de dins dels nostres cossos. Les nostres cèl·lules estan protegides per unes “parets” que són en realitat una capa de greix anomenada membrana, però quan s’afegeix una gota de detergent es trenca la membrana cel·lular i l’ADN s’allibera en l’aigua. Quan s’afegeix l’alcohol els fils d’ADN migren gradualment cap a aquest i s’uneixen a altres fils d’ADN. Com més i més filaments s’enganxen, l’ADN es va fent visible a simple vista. No és sorprenent que aquestes diminutes molècules tinguin tota la informació que fan que vostè sigui únic?

  • Cap comentari »


© IMIM Institut Municipal d'Investigació Mèdica 2008 - Avís legal - Accessibilitat - Creative Commons